Stoniškių seniūnija – viena iš penkių Pagėgių savivaldybės administracinių seniūnijų, įkurta 1997 m. lapkričio 14 d. Seniūnijos centras – Stoniškiai.
2026 m. seniūnijoje deklaruota 1565 gyventojai. Teritorijos plotas – 13,4 tūkst. ha. Vietinės reikšmės keliai sudaro 114,326 km. Seniūnijos teritorijoje yra 1 kultūros paveldo objektas ir 2 veikiančios kapinės (bendras plotas – 6,24 ha).

Seniūniją sudaro 25 kaimai: Aleknai, Anužiai, Berštininkai, Dinkiai, Karceviškiai, Kovgiriai, Kuciai, Lazdėnai, Mažaičiai, Naujapieviai, Nausėdai, Pageldyniai, Pakamoniai, Peleniai, Plaškiai, Pleinė, Rėžiai, Rukai, Spengiai, Stoniškiai, Stumbragiriai, Šilgaliai, Šuneliai, Tutliai, Vičiai.

Seniūnė – Dalia Alkimavičienė (dirba nuo 2020 m. gruodžio 14 d.

Dirbę seniūnai (istorija): Juozapas Balandis (pirmininkas, viršaitis), Viktoras Mišeikis (viršaitis), Robertas Maziliauskas, Stanislovas Bagdonas, Ričardas Bartkevičius, Gintautas Stančaitis, Ričardas Būdvytis.

Seniūnaitijos (6): Rukų, Stoniškių, Šilgalių, Pakamonių, Plaškių, Anužių.

Bendruomenės (3): Šilgalių, Stoniškių, Plaškių.

Veikiančios įstaigos ir paslaugos:

• 2 bibliotekos;
• pirminės sveikatos priežiūros centras;
• kultūros namai;
• 2 vaikų dienos centrai;
• vieša pirtis;
• mobilusis laiškininkas;
• katalikų ir evangelikų bažnyčios;
• VSAT Pagėgių rinktinės Plaškių užkarda;
• UAB „Lietuvos žirgynas“ ;
• UAB „Stoniškių žara“;
• 4 parduotuvės;
• AB „Akmenės cementas“ .

Seniūnijoje patvirtinti 8 etatai: seniūnas, raštvedė, vyresnysis specialistas (ūkvedys), socialinio darbo organizatorė, pirties ir kapinių priežiūros darbininkė, darbininkas–kūrikas, traktorininkas–kūrikas, valytoja.

Vykdomi darbai, renginiai ir projektai:

• išasfaltuotas kelias į Rukų kapines ir kelias per Anužių gyvenvietę;
• apšvietimo stulpų atnaujinimas ir įrengimas Topolių g., Mažaičių k.;Parko g., Šilgalių k.
• projektas „Sennemunės ežero pakrantės sutvarkymas“;
• Rukų kaimo žaidimų aikštelės įrengimas;
• tradicinė vasaros šventė „Baltojo dobilo laimė“;
• advento tradicijų vakaras ir kalėdinės eglutės įžiebimas.